Соглашение с 28-летним футболистом рассчитано до лета 2020 года, другие детали сделки не раскрываются.
Ранее СМИ сообщали, что за казанский клуб получит за бразильца 8 миллионов евро.
В своей новой команде форврад будет выступать под номером 9, а уже сегодня проведет первую тренировку с партнерами.
Жонатас перебрался в Рубин летом прошлого года из Реал Сосьедада, с тех пор сыграв 35 матчей и забив 15 голов во всех турнирах за клуб.